venerdì 29 agosto 2008

alle prese con zootecnia

PROGENY TEST
è un metodo utilizzato negli allevamenti, assieme all'osservazione del pedigree, per individuare i portatori di gni recessivi. il sospetto portatore viene fatto accoppiare con femmine con determinato genotipo noto:
*se almeno un figlio manifesta fenotipo recessivo si ha la certezza che il "proband" è portatore recessivo;
*se nessun figlio manifesta fenotipo recessivo, superato un certo numero di figli sani (che dipende dal genotipo della popolazione di prova, cioè delle femmine con cui è stato fatto accoppiare il maschio sospetto e dal livello di confidena desiderato), si raggiunge il livello desiderato di confidenza.

il livello di confidenza è la percentuale di certezza per cui il proband non è portatore. la percentuale aumenta all'aumentare del numero dei figli, ma non raggiungerà mai il 100%.

procedimento:
1) si assume che il proband abbia genotipo eterozigote: Aa.

2)si calcola la probabilità di osservare fenotipo dominante in un figlio. ad esempio con popolazione di prova Aa:
Aa x aa: 1/2 Aa + 1/2 aa

3)si calcola la probabilità di osservare in tutti n figli fenotipo dominante: (1/2)^n

4)si calcola la PROBABILITA' DI RILEVAMeTNO) ovvero la probabilità di osservare almeno 1 figlio con fenotipo recessivo:
 1-(1/2)^n

per calcolare il numero di figli necessario al raggiungimento del livello di confidenza desiderato (solitamnte 95% o 99%) si opera così:

0,95= 1-(1/2)^n
da cui:
log 0,05= n log(1/2)
n=4,32

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